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PRACTICES/MASTER THESIS OFFER 2021 - 2022

Centro de Biotecnología y Genómica de Plantas
ID Título Tutor/es Requisitos Nº Plazas Horas semanales Horario ESTADO
CBGP1
Dra Maria Garrido / Dr. Mariano Perales
Computational Biology Master Student Experience in Structural Bioinformatics Skills with programming languages
1
20H
Flexible

CERRADA

CBGP2
Elena Caro
Estudiante de Master de Biología Computacional con interés en análisis de resultados de experimentos de secuenciación masiva.
1
15H
Flexible

 

CBGP3
Julio Isidro Sánchez
Master student with background on: - R Programming and computational biology tools. - Analysis and bioinformatic interpretation of different omics data set - Statistical modelling - English is mandatory.
1
25H
Flexible

 

CBGP4
Julio Isidro Sánchez
Master student with background on: - R Programming and computational biology tools. - Analysis and bioinformatic interpretation of different omics data set - Statistical modelling - English is mandatory.
1
25H
Flexible

 

CBGP5
Julio Isidro Sánchez
Master student with background on: - R Programming and computational biology tools. - Analysis and bioinformatic interpretation of different omics data set - Statistical modelling - English is mandatory.
1
25H
Flexible

 

CBGP6
Alejandro Couce
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1
TBD
TBD

 

Cluster of Excellence on Plant Sciences
ID Título Tutor/es Requisitos Nº Plazas Horas semanales Horario ESTADO
CEPLAS1
Alga Zuccaro
R, Linux and programming skills required, preferentially in Python. Genuine interest in plant microbe interactions and microbiome studies is advantageous. It is expected that the student is fluent in English.
1
Flexible
Flexible

 

CEPLAS2
 
· Language: good written and verbal English skills.

· Coding language: basic knowledge of Python

Operating system: basic knowledge of Linux commands
1
 
 

 

CEPLAS3
Dr. Anna Matuszyńska
 
Programming skills required, preferentially in Python
Strong understanding of calculus (in particular solving systems of ordinary
differential equations)
Genuine interest in plant biology and biochemistry is advantageous
Working language: English
1
 
 

 

CEPLAS4
Bart Thomma

·         Proven proficiency in programming (e.g., Python and/or R)

Basic knowledge on microbiology and/or microbial ecology
1
Flexible
 

 

CEPLAS5
George Coupland
Experience in coding and scripting is required (most importantly Python and Matlab; C++ or C would be desirable). Some knowledge on modelling gene regulatory networks through ordinary differential equations would be helpful. It is expected that the student is fluent in English.
1
Flexible
Flexible.

 

CEPLAS6
Stanislav Kopriva
Is expected that the student is fluent in English. Experience in coding and scripting is essential. Previous experience is RNA-Seq. analysis is desirable. Motivation to learn about plants is advantageous.
1
Flexible
Flexible

 

CEPLAS7
Franziska Turck
The student should be familiar with using and adapting established bioinformatics pipelines that are used in genomics (Bowtie2/MEME suite/Homer suite/Deeptools/various R pipelines). All pipelines will be run as command line tools on the MPIPZ compute cluster. Bash scripting and writing plugins e.g. using R/Bash scripting/Python should be done autonomously, solid statistical background is a plus. The group members are mostly experimental biologists with a strong background in epigenetics, but there will be a second Master student from the University of Cologne with a data analysis project. The student can expect ample training in epigenetics, but should be rather self-sufficient in computational approaches.
1
40
9:00-18:00

 

Centro Nacional de Biotecnología
ID Título Tutor/es Requisitos Nº Plazas Horas semanales Horario ESTADO
CNB1
Pilar Cubas Domínguez
Training in Biotechnology or Bioengineering, good command of English. A previous lab experience as well as familiarity with molecular biology techniques and phylogenetic analysis will be considered as a plus.
1
20
Flexible

CERRADA

CNB2
José Ramón Valverde Carrillo
Degree or Master student in areas of Life and Health Sciences, Bioinformatics, Computational Biology or Informatics/Computer Science. English. Tasks will be adapted to the training of the student.
1-2
-
Flexible, between 09:00 and 17:00

 

CNB3
Carlos Óscar Sorzano Sánchez
Conocimientos de python y linux
5
Flexible
Flexible

 

Centro Nacional de Investigaciones Cardiovasculares
ID Título Tutor/es Requisitos Nº Plazas Horas semanales Horario ESTADO
CNIC1
Miguel Sánchez Álvarez / Fidel Lolo Romero
Estudiante del Máster en Biología Computacional. CV previo: - Graduado en Biotecnología - Inglés B2
1
15-30
9-12/9-13/15-17

CERRADA

CNIC2
Fátima Sánchez Cabo
Estudiante de Máster de Biología Computacional
1
25
9:30 - 14:30

CERRADA

Consejo Superior de Investigaciones Científicas
ID Título Tutor/es Requisitos Nº Plazas Horas semanales Horario ESTADO
CSIC1
Mercedes Martín-Martínez
Estudiante de Máster en Biología Computacional
1
A acordar con el alumno
A acordar con el alumno en jornada de 9 a 18 h

 

Centro de Tecnología Biomédica
ID Título Tutor/es Requisitos Nº Plazas Horas semanales Horario ESTADO
CTB1
Alejandro Rodríguez González
Computational Biology Master student
1
25-30
 

CERRADA

CTB2
Carmen Ramírez Castillejo
Estudiante del Master in Computational Biology
1
A convenir
Entre 9:00-16:30

CERRADA

European Bioinformatics Institute (EMBL-EBI)
ID Título Tutor/es Requisitos Nº Plazas Horas semanales Horario ESTADO
EMBL1
Maria J. Martin
Student in the Grade of Masters. The student should have a good background in one programming language e.g. Phython. Interest in data science and some biological background would be helpful. The student should be proficient in the English language.
1
25-39
8h

 

Escuela Técnica Superior de Ingeniería Agronómica, Alimentaria y de Biosistemas
ID Título Tutor/es Requisitos Nº Plazas Horas semanales Horario ESTADO
ETSIAAB1
Krzysztof Wabnik
Training in Biotechnology or Bioengineering, good command of English, previous lab experience is desired, familiarity with molecular biology techniques, previous experience with Phyton, R, Image analysis computational tools is a plus
1
22.5
9:30-14:00

 

ETSIAAB2
Thomas Suply
M2 Student with experience in coding and scripting, at least, use of python, bash, and R. Experience with clusters. The student should be used to use and adapt established bioinformatics pipelines that are used in genomics (Bowtie2/MEME suite/Homer suite/Deep tools/various R pipelines/STAR/DESEq). It is expected that the student is fluent in English and French.
1
35
TDB

CERRADA

Escuela Técnica Superior de Ingenieros de Minas y Energía.
ID Título Tutor/es Requisitos Nº Plazas Horas semanales Horario ESTADO
ETSIME1
Ángel Fidalgo Blanco
Estudiantes del Grado en Biotecnología. Se valorarán conocimientos de algoritmia y del entorno de programación R y buen nivel de idioma inglés.
1-2
15
15:00 - 18:00

 

HI - Iberia
ID Título Tutor/es Requisitos Nº Plazas Horas semanales Horario ESTADO
HIIBERIA1
Roberto G.E. Martín
• Conocimientos/experiencia lenguajes: Python y/o JavaScript
• Conocimientos/experiencia con software: git / github / gitlab
• Pasión/Mucho interés en: o Programación de sistemas de IA o Leer y aprender. Formación continua. • El campo de IA está en plena evolución, necesitamos personas que no les dé miedo enfrentarse a retos complejos. Como pueden ser, los desarrollos de agentes de IA para sistemas industriales.
2
25h (en función del alumno)
8:00-14:00

 

Ontology Engineering Group
ID Título Tutor/es Requisitos Nº Plazas Horas semanales Horario ESTADO
OEG1
Carlos Badenes Olmedo
Estudiante de máster de biología computacional.
1
10h
12:00-14:00

CERRADA

OEG2
Carlos Badenes Olmedo
Estudiante de máster de biología computacional.
1
10h
12:00-14:00

CERRADA

Universidad Complutense de Madrid
ID Título Tutor/es Requisitos Nº Plazas Horas semanales Horario ESTADO
UCM1
FRANCISCO MONROY MUÑOZ / NICCOLO CASELLI
Student in the Grade of Biology/ Informatics /Engineering. Orientation: computational biophysics. Proficiency in MATLAB usage and programming.
1
25H
5h

 

UCM2
José Luis Ayala Rodrigo
Estudiante de máster. Conocimientos de bioinformática, programación, inglés. Capacidad de trabajo en equipo.
1
15h
9:00-12:00, o 15:00-18:00

 

UCM3
José Luis Ayala Rodrigo
Estudiante de máster. Conocimientos de bioinformática, programación, inglés. Capacidad de trabajo en equipo
1
15h
9:00-12:00, o 15:00-18:00

CERRADA

UCM4
Dr. Horacio Lopez Menendez / Francisco Monroy
Biotecnologos, Ingenieros, Físicos, Experiencia en programación (Matlab, Mathematica), Matemática aplicada, manejo de células (no excluyente)
2
20h
A convenir

 

UCM5
FRANCISCO MONROY MUÑOZ
Grado en Ciencias o Ingeniería, Orientación bioinformática, biofísica y/o biología computacional. Informática: Conocimientos de programación en MATLAB y/o MATHEMATICA
1
 
 

 

UCM6
José Luis Ayala Rodrigo
Estudiante de máster. Conocimientos de bioinformática, programación, inglés. Capacidad de trabajo en equipo.
1
15
9:00-12:00, o 15:00-18:00

 

 

f t m